Scores

Each row corresponds to a position in the reference protein. Below each position is the fraction of sequences that contain one of the basic amino acids. A low fraction indicates the position is either severely gapped or unalignable and has little information. Expect poor prediction at these positions.
Each column corresponds to one of the twenty amino acids.
Each entry contains the score at a particular position (row) for an amino acid substitution (column). Substitutions predicted to be intolerant are highlighted in red.


pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
1P 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
2Q 0.95 0.01 0.00 0.02 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
3I 0.95 0.03 0.01 0.01 0.01 0.77 0.01 0.01 1.00 0.01 0.71 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.32 0.03 0.25
4T 0.95 0.09 0.02 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.06 0.35 0.03 0.02 0.97 1.00 0.04 0.01 0.01
5L 0.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
6W 0.95 0.03 0.00 0.01 0.01 0.03 0.03 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.02 0.01 1.00 0.02
7Q 0.95 0.02 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 0.02 0.01 0.60 0.02 0.01 0.02 0.01 0.91 1.00 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01
8R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
9P 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
10L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 0.00 0.80 0.01 1.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.87 0.00 0.01
11V 1.00 0.12 0.02 0.02 0.17 0.02 0.04 0.04 0.17 0.47 0.11 0.03 0.05 0.05 0.12 0.32 0.05 0.10 1.00 0.01 0.03
12T 1.00 0.17 0.01 0.10 0.32 0.02 0.08 0.07 0.05 0.54 0.09 0.03 0.11 0.13 0.21 0.59 0.15 1.00 0.07 0.01 0.03
13I 1.00 0.67 0.10 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.62 0.02 0.09 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.08 1.00 0.00 0.00
14K 1.00 0.50 0.18 0.20 0.27 0.70 0.33 0.54 0.40 0.30 0.64 0.22 0.31 0.20 0.29 0.35 0.40 0.39 0.50 0.18 1.00
15I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00
16G 1.00 0.22 0.01 0.65 1.00 0.02 0.25 0.08 0.02 0.22 0.05 0.02 0.30 0.13 0.25 0.07 0.20 0.12 0.05 0.01 0.04
17G 1.00 0.04 0.00 0.12 0.09 0.00 1.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.04 0.01 0.01 0.01 0.16 0.01 0.04 0.00 0.00
18Q 1.00 0.33 0.06 0.09 0.17 0.06 0.08 0.21 0.24 0.35 0.22 0.07 0.13 0.12 1.00 0.28 0.28 0.57 0.67 0.02 0.07
19L 1.00 1.00 0.12 0.13 0.13 0.06 0.45 0.04 0.16 0.16 0.24 0.08 0.19 0.36 0.12 0.11 0.96 0.97 0.35 0.02 0.05
20K 1.00 0.18 0.06 0.01 0.03 0.04 0.01 0.01 0.60 0.22 0.23 0.06 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.14 1.00 0.01 0.02
21E 1.00 0.01 0.00 0.01 1.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.33 0.01 0.00 0.01 0.01 0.11 0.22 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00
22A 1.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.02 0.00 0.03 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.02 0.02 0.48 0.00 0.00
23L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
24L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
25D 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
26T 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 1.00 0.00 0.00 0.00
27G 1.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.04 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00
28A 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.04 0.00 0.00
29D 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00
30D 1.00 0.02 0.01 1.00 0.04 0.01 0.03 0.01 0.13 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.00 0.01
31T 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.46 1.00 0.00 0.00 0.00
32V 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00
33L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 1.00 0.00 0.91 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.98 0.00 0.01
34E 1.00 0.77 0.04 0.44 1.00 0.04 0.29 0.09 0.13 0.76 0.21 0.07 0.41 0.19 0.46 0.37 0.61 0.44 0.20 0.01 0.03
35E 1.00 0.17 0.01 0.54 1.00 0.02 0.29 0.06 0.02 0.18 0.04 0.01 0.23 0.10 0.20 0.08 0.15 0.09 0.04 0.01 0.03
36M 1.00 0.75 0.09 0.38 0.78 0.10 0.24 0.12 1.00 0.67 0.38 0.48 0.37 0.22 0.39 0.35 0.49 0.59 0.73 0.03 0.10
37S 1.00 0.07 0.00 0.96 1.00 0.01 0.05 0.02 0.01 0.30 0.02 0.01 0.63 0.03 0.25 0.04 0.35 0.05 0.02 0.00 0.01
38L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.02 0.00 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.11 0.01
39P 1.00 0.77 0.08 0.42 0.33 0.05 1.00 0.13 0.07 0.67 0.14 0.06 0.47 0.88 0.37 0.42 0.66 0.29 0.15 0.02 0.08
40G 1.00 0.11 0.02 0.39 0.13 0.02 1.00 0.06 0.02 0.13 0.03 0.01 0.37 0.28 0.08 0.10 0.45 0.33 0.03 0.01 0.03
41R 1.00 0.65 0.05 0.71 0.86 0.05 0.33 0.26 0.16 1.00 0.33 0.09 0.97 0.29 0.51 0.75 0.70 0.56 0.25 0.02 0.05
42W 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.48
43K 0.95 0.28 0.05 0.20 0.30 0.13 0.16 0.13 0.12 1.00 0.19 0.07 0.18 0.11 0.34 0.43 0.49 0.50 0.21 0.04 0.18
44P 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.07 0.01 0.00 0.00 0.00
45K 1.00 0.03 0.00 0.01 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 1.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.02 0.14 0.00 0.00
46M 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.08 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.22 0.00 0.00
47I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00
48G 1.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 1.00 0.12 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00
49G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
50I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
51G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
52G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
53F 1.00 0.37 0.06 0.84 0.26 0.28 0.79 0.19 0.04 0.26 0.08 0.03 1.00 0.19 0.17 0.14 0.55 0.22 0.07 0.02 0.11
54I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.27 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00
55K 1.00 0.12 0.01 0.06 0.16 0.02 0.10 0.14 0.05 1.00 0.11 0.04 0.44 0.16 0.26 0.69 0.11 0.12 0.06 0.02 0.05
56V 1.00 0.06 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.07 0.01 0.05 0.17 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.50 1.00 0.00 0.00
57R 1.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.04 0.01 0.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.68 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00
58Q 1.00 0.02 0.00 0.04 1.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.23 0.01 0.00 0.01 0.01 0.84 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00
59Y 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.04 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.01 0.02 1.00
60D 1.00 0.15 0.01 1.00 0.22 0.02 0.15 0.06 0.04 0.78 0.06 0.02 0.28 0.07 0.24 0.35 0.25 0.13 0.05 0.01 0.03
61Q 1.00 0.04 0.01 0.77 0.06 0.01 0.25 0.04 0.00 0.05 0.01 0.00 1.00 0.03 0.70 0.03 0.10 0.04 0.01 0.00 0.02
62I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.92 0.00 0.07 0.01 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.01 1.00 0.00 0.01
63L 1.00 0.72 0.17 0.46 1.00 0.63 0.43 0.56 0.41 0.87 0.78 0.24 0.45 0.34 0.59 0.71 0.59 0.56 0.54 0.17 0.92
64I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00
65E 1.00 0.10 0.01 0.18 1.00 0.01 0.22 0.02 0.02 0.37 0.04 0.01 0.07 0.05 0.24 0.19 0.08 0.07 0.03 0.00 0.01
66I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.30 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.91 0.00 0.00
67C 1.00 0.39 0.09 0.04 0.09 0.15 0.03 0.05 0.67 0.09 0.70 0.17 0.05 0.09 0.07 0.07 0.09 0.28 1.00 0.03 0.08
68G 1.00 0.02 0.00 0.35 0.02 0.00 1.00 0.02 0.00 0.02 0.00 0.00 0.50 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.00 0.00 0.01
69H 1.00 0.03 0.00 0.01 0.05 0.01 0.02 0.34 0.01 1.00 0.03 0.01 0.03 0.03 0.10 0.39 0.03 0.04 0.02 0.01 0.04
70K 1.00 0.17 0.02 0.05 0.22 0.06 0.13 0.13 0.19 1.00 0.20 0.08 0.15 0.12 0.33 0.81 0.14 0.17 0.18 0.03 0.09
71A 1.00 0.65 0.03 0.01 0.02 0.02 0.00 0.00 0.44 0.02 0.32 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.26 1.00 0.00 0.01
72I 1.00 0.39 0.10 0.09 0.17 0.29 0.14 0.20 0.79 0.35 0.61 0.16 0.15 0.13 0.19 0.33 0.19 0.31 1.00 0.07 0.34
73G 1.00 0.33 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.03 0.02 0.01 0.01 0.00 0.00
74T 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.20 1.00 0.00 0.00 0.00
75V 0.95 0.05 0.03 0.03 0.03 0.07 0.04 0.06 1.00 0.03 0.06 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 1.00 0.03 0.09
pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
76L 0.95 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.03 0.04 0.03 0.02 1.00 0.52 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.06
77V 0.95 0.15 0.06 0.07 0.09 0.20 0.10 0.16 0.63 0.09 0.27 0.07 0.10 0.07 0.09 0.11 0.12 0.87 1.00 0.06 0.28
78G 0.95 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 1.00 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03
79P 0.95 0.47 0.10 0.80 0.23 0.34 0.20 0.27 0.21 0.23 0.34 0.12 0.20 1.00 0.20 0.22 0.46 0.25 0.27 0.10 0.47
80T 0.95 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 1.00 0.02 0.01 0.03
81P 0.95 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 1.00 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03
82V 0.95 0.04 0.02 0.02 0.03 0.05 0.03 0.04 1.00 0.03 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.65 0.02 0.07
83N 0.95 0.02 0.01 0.10 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 1.00 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04
84I 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
85I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 1.00 0.00 0.34 0.04 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.05 0.01 0.01
86G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
87R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
88N 1.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00
89L 1.00 0.02 0.20 0.00 0.01 0.12 0.00 0.00 0.90 0.01 1.00 0.12 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.01 0.01
90L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 1.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00
91T 0.97 0.29 0.01 0.07 0.23 0.00 0.03 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.09 0.02 0.20 0.03 0.07 1.00 0.02 0.00 0.01
92Q 0.97 1.00 0.08 0.36 0.58 0.05 0.52 0.10 0.12 0.73 0.21 0.08 0.31 0.29 0.62 0.46 0.62 0.44 0.22 0.02 0.05
93I 0.97 0.22 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 0.49 0.01 1.00 0.12 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.05 0.00 0.01
94G 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
95C 0.97 1.00 0.15 0.07 0.09 0.11 0.53 0.03 0.16 0.10 0.46 0.17 0.07 0.24 0.08 0.08 0.48 0.18 0.22 0.02 0.06
96T 0.97 0.12 0.02 0.05 0.08 0.02 0.06 0.05 0.04 0.65 0.06 0.03 0.10 0.07 0.12 0.43 0.73 1.00 0.06 0.01 0.03
97L 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
98N 0.82 0.03 0.00 0.03 0.01 0.00 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 1.00 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.08 0.00 0.00
99F 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00